《雄兵连》系列是国内首部3D军事科幻题材动漫作品，《雄兵连3雷霆万钧》为该系列故事最新续作，剧情承接上一季，讲述地球与天使阵营结盟，共同对抗外星恶势力的故事。

有个爱画画的孩子叫马良。他有一支神笔，用这支神笔画的东西都会变成真的。皇帝知道了，要马良为他画画，马良画了座有金银财宝的小岛，又画了一条大船，当皇帝和大臣、将军们坐船去取钱时，风浪把他们全都吞没了。

故事发生在风景秀丽的百花村，在那里，生活着一个名为马良（邵亦琛 饰）的男孩，马良虽然顽皮，却热爱画画，颇有天赋。某日，大将军（孟祥龙 配音）和小皇帝（王晓彤 配音）的到来打破了村庄内宁静的气氛，他们得知在村庄地下埋藏着价值…