故事的的舞台是2012年已经废弃的东京新宿。因遗传因子受到污染，全世界的男性全部灭绝。而面对绝种的境地，世界上仅存的女性分成了接受命运的享乐派与相信科学改变命运的奋斗派。独眼战士率领着卫士队领受了镇压的任务，机缘巧合下发现了…