在第二季中，主人公空操弹马、丸藏兆治等熟悉的角色均悉数登场。新作讲述的是为了为爆丸们居住的星球夺回自由与和平，主人公与其它爆丸合力，解放被捉的爆丸，再集结成新的团队一起战斗的故事。